Описание
- Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой кислоты (ДНК/РНК) в биологическом материале (пробе).
- ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ) – разновидность метода ПЦР, при котором детекция ПЦР-продукта происходит по мере его накопления, т.е. после каждого цикла амплификации.
Микрочиповый амплификатор нуклеиновых кислот «АриаДНА»
- Позволяет проводить ПЦР-РВ в ячейках микрочипа с лиофилизированными компонентами ПЦР-смеси;
- Позволяет последовательно проводить обратную транскрипцию (ОТ-ПЦР) и ПЦР-РВ на микрочипе (необходимо, если в качестве пробы используется выделенная РНК).
Микрочип
- Стандартная модификация микрочипа содержит 30 ячеек (микрореакторов) с лиофилизированными ПЦР-смесями;
- реакционная зона выполнена из кремния или алюминия;
- использование материалов с высокой теплопроводностью и малый объем ПЦР-смеси позволяют сократить время анализа;
- гидрофильная поверхность ячеек облегчает и ускоряет внесение пробы внутрь ячеек;
- гидрофобная поверхность вне ячеек предотвращает вытекание пробы за границы ячейки;
- объем ячейки 1.2 мкл.
Отличительные характеристики микрочипового амплификатора нуклеиновых кислот «АриаДНА»
- Длительность анализа (45 циклов ПЦР) – 30–50 мин.: за счет высокой скорости нагрева/охлаждения образцов (10–12 °С/с);
- Малый расход пробы: 1.2 мкл пробы/ячейка;
- Нет необходимости готовить ПЦР-смеси, они уже лиофилизированы на микрочипе. Это значительно сокращает время подготовки к анализу;
- Минимизация риска контаминации: проба вводится под слой герметизирующей жидкости;
- Программное обеспечение к прибору: удобный пользовательский интерфейс, отображение текущих результатов ПЦР-РВ, автоматическая компиляция отчетов, экспорт результатов, разграничение доступа.
Подготовка пробы и проведение ПЦР-анализа
- Образцы ДНК/РНК выделяются из отобранного пат. материала с использованием коммерческих наборов, согласно инструкциям;
- Выделенные образцы ДНК/РНК дозируются в ячейки микрочипа;
- Микрочип помещается в прибор;
- С помощью ПО настраивается протокол термоциклирования и запускается анализ;
- Аналитический сигнал, создаваемый ПЦР-продуктами, в реальном времени выводится на экран монитора в виде графика.
Микрочип с лиофилизированными ПЦР-смесями предназначен для однократного использования.
Хранение и транспортировка микрочипов осуществляется при комнатной температуре!
Технические характеристики
| Полное время анализа (45 циклов) | 30–50 мин |
| Минимальное содержание ДНК в анализируемой пробе | 1–5 копий 2–5 геном-экв/мкл |
| Скорость термоциклирования | нагрев 12 °С/с, охлаждение 10 °С/с |
| Количество микрореакторов в одном микрочипе | 20, 24, 30, 48 |
| Объем ячеек | 1.0, 1.2, 2.4, 3.6 мкл |
| Малый расход пробы (2-кратная ПЦР-смесь) | 0.5–1.8 мкл |
| Расход пробы | 0.5–1.8 мкл/ячейка |
| Использование микрочипов, содержащих лиофилизированные тест-системы | да |
| Канал детектирования 1, краситель | FAM, SYBR-Green I |
| Канал детектирования 2, краситель | ROX |
| Управление от внешнего персонального компьютера | да |
| Специализированное программное обеспечение для запуска ПЦР-анализа, настройки параметров анализа, обработки результатов | да |
Области применения
- Ветеринария
- Аквакультура
- Пищевая промышленность
- Научные изыскания